Cuando llegaron los Españoles los mayas ya habían sido colonizados por los Itzáes, indios del grupo totelcomaya, que ocupaban el territorio en torno al lago Petén Itzá. Este lago es una gran reserva de vida salvaje, un territorio que aún permanece virgen rodeado de viejas ceibas y caobas. El Biotopo Protegido de Cerro Cahuí es la única reserva de bosque situada a orillas del lago Petén Itzá, desde donde se pueden observar las diferentes especies animales de la región; mamíferos menores y aves. En una de sus islas está asentada la cabecera del departamento del Petén, Flores.

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